🔍 耿同学打假报告

论文信息

• 论文来源：CGMega.pdf (https://doi.org/10.1038/s41467-024-50426-6)
• 标题：CGMega: explainable graph neural network framework with attention mechanisms for cancer gene module dissection
• 作者：Hao Li, Zebei Han, Yu Sun, 等
• 期刊：Nature Communications
• DOI：10.1038/s41467-024-50426-6
• 发表年份：2024 (Accepted: 9 July 2024)

综合评定：🟠 高度可疑

作为一篇主打干湿结合（生信预测+基础实验验证）的顶刊文章，干生信部分的数据逻辑链看似完整，但一旦到了真实的“湿实验”验证环节，就暴露出极其粗劣的拼接与伪造痕迹，特别是实验方法学部分出现了违背常识的“缝合怪”抗体信息。

详细发现

发现 1：抗体信息离谱错乱（张冠李戴的缝合怪）

• 位置：Methods 部分 -> Western blot analysis (Page 12)
• 描述：作者在描述一抗信息时，出现了严重的厂商目录号（Cat No）与克隆号/来源严重不匹配的现象。
  • BRCA2 抗体描述：写明为 Abcam 公司的 EPR23442-43 克隆，却紧跟着标注了 Cat No 29450-1-AP。事实上，29450-1-AP 是武汉 Proteintech（三鹰）公司的 BRCA2 兔多克隆抗体产品线，而 FACD, FANCD1 是基因别名而非克隆名。
  • ROCK2 抗体描述：写明为 SANTA CRUZ 公司（带 sc-100425 目录号），却又紧跟了一个 Cat No 21645-1-AP。同样，21645-1-AP 是 Proteintech 公司的 ROCK2 兔多克隆抗体，后面的 KIAA0619 等也是基因别名。
• 证据：正常做实验的研究人员绝不会把自己使用的抗体公司、目录号和来源搞错成这样，更不可能把 Abcam/SC公司的抗体贴上 Proteintech 的专属"-AP"后缀目录号。这种“缝合怪”式写法极度符合 AI 幻觉生成或粗劣的 copy-paste 伪造特征。
• 严重程度：🔴 (伪造实验细节的实锤线索)

发现 2：统计学异常（n=3 却得出极度完美的 p 值）

• 位置：Figure 4h 及图注；Results 段落
• 描述：作者声称在处理 24h 后，olaparib/RKI-1447 联合用药组的抑制率显著高于单药组，给出了 P value = 0.0023（paired t test, 双尾）。同时图注明确写道 n = 3 biologically independent experiments。
• 证据：配对 t 检验在只有 3 对（自由度 df = 2）的情况下，t 分布的尾部极宽。要达到 P = 0.0023 的显著性，意味着两组数据的差值均值必须是标准差的 9 倍以上（t ≈ 15.8）。真实的生物学重复实验存在极大的操作误差和生物个体差异，n=3 就能达到 0.002 级别的 p 值，说明数据被处理得“比随机数生成器还要完美无瑕”，或者根本没有做真实的 3 次独立重复，只是用同一个假数据乘算得出的。
• 严重程度：🟠

发现 3：文本中未提供足够的图片信息，无法进行像素级分析

• 位置：Figure 4e, 4f, 4g
• 描述：由于仅提供了文本形式，无法查看文章中 Western Blot（图 4e）的条带是否有背景突变、是否拼接，也无法验证测定 IC50 的细胞活力实验原始散点分布。
• 证据：鉴于前文在抗体信息和 p 值上出现了严重异常，我们有充分理由怀疑其 WB 条带和细胞活力柱状图的真实性。需要读者下载其 Supplementary Source Data 或图片原图进行像素级比对。
• 严重程度：未知

耿同学辣评

干生信写得像花一样，到了湿实验验证却露了马脚。连自己买的抗体是哪家公司的、什么目录号都分不清（Abcam 长出了 Proteintech 的尾巴），还硬是用 3 个样本算出了 p=0.0023 的“神仙数据”。这种为了迎合生信预测结果而强行 PS 出来的干湿结合，当个故事听听就算了，谁信谁去复现谁就 graduated early（提前毕业/退学）！

建议后续行动

• 联系作者要求提供完整的、带有未经裁剪的原始 Western Blot 孔径图（全膜图）。
• 要求作者提供细胞活力测定的 3 次独立重复的详细数值和原始酶标仪输出文件。
• 在 PubPeer 上针对抗体信息错乱和 n=3 超显著 p 值提出公开质疑。
• 向期刊编辑部举报，要求核查实验数据的真实性。

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